Najveća dubina na Šaskom jezeru iznosi oko devet metara i nalazi se u rukavcu koji se naziva Begovo oko. Na tom mjestu je podvodni izvor koji ovo jezero ljeti snadbjeva slanom vodom, zbog čega se u njegovom sistemu mogu naći i neke morske riblje vrste.
Najviši srednji mjesečni vodostaj Jezera se javlja u februaru, a najniži u avgustu.