Diverzitet riba na ulcinjskom području je znatno smanjen prethodnih decenija mnogim antropogenim intervencijama, kao što su izgradnja brana na Drimu u Albaniji (što je izazvalo smanjenje otoka u Bojanu i gubitak uzvodnih mrijestiišta), izgradnja Solane (gubitak velikih mrijestilišta u nekadašnjem zalivu), zagađenje i neprimjereno održavanje preostalih močvarnih područja i zalivskih relikata povezanih sa Port Milena (gubitak staništa).
Uprkos ovim intervencijama, vodeni sistem delta Bojane je i dalje veoma važno stanište riba. Eksperti iz Albanije i Crne Gore su registrovali 143 vrste i podvrste riba, a 107 vrsta riba je zabilježeno na crnogorskoj strani (u Šaskom jezeru, Bojani i moru).
U Bojani se može naći 13 vrsta riba koje migriraju iz Skadarskog jezera u Jadransko more i obrnuto. Gotovo 70 % rječnih vrsta riba spada u šarane. Na ušću rijeke ima oko 50 vrsta riba.
Osim riba, u ovom području u manjem broju i dalje postoje: evropska sipa, oktopod, školjke, krabe, ostrige i morske zvijezde.
